Balai Pelaksanaan Jalan Nasional (BPJN) Sumatera Barat menjalankan perannya melalui empat unit pelaksana utama yang masing-masing disebut sebagai Satuan Kerja (Satker). Setiap Satker membawahi beberapa Pejabat Pembuat Komitmen (PPK) yang bertanggung jawab terhadap pelaksanaan program dan kegiatan teknis di lapangan. Struktur organisasi tersebut mencakup:

1. Satker Perencanaan dan Pengawasan Jalan Nasional Sumatera Barat, yang berfokus pada penyusunan rencana teknis serta pengawasan terhadap pekerjaan infrastruktur jalan dan jembatan.

2. Satker Pelaksanaan Jalan Nasional Wilayah I Provinsi Sumatera Barat, yang menangani kegiatan pelaksanaan konstruksi dan preservasi jalan pada wilayah kerja bagian utara dan barat diprovinsi sumatera barat.

3. Satker Pelaksanaan Jalan Nasional Wilayah II Provinsi Sumatera Barat, yang menangani kegiatan pelaksanaan konstruksi dan preservasi jalan pada wilayah kerja bagian timur dan selatan diprovinsi sumatera barat.

4. Satker Perangkat Daerah Tugas Perbantuan, yang melaksanakan program kerja pusat melalui pola tugas perbantuan kepada pemerintah daerah.

Setiap Satker tersebut memiliki tim teknis tersendiri, termasuk beberapa PPK, yang memastikan agar kegiatan berjalan sesuai dengan regulasi dan target kinerja yang telah ditetapkan oleh Kementerian PU. Struktur ini dirancang untuk mendukung kelancaran pelaksanaan pembangunan dan pemeliharaan infrastruktur jalan secara lebih terkoordinasi di wilayah Sumatera Barat.